Protocolo é a descrição de uma situação específica de assistência que contém detalhes operacionais e especificações sobre o que se faz, quem faz e como se faz, conduzindo os profissionais nas decisões de assistência para a prevenção, recuperação ou reabilitação da saúde. Um protocolo contém vários procedimentos (COREN-SP, 2014).
É a exata sequência em que uma ação deve ser realizada. Os protocolos assistenciais podem também ser descritos em forma de algoritmos, que são diagramas de fácil memorização.
Devem ser sistematicamente desenvolvidos e necessitam detalhar a adoção e aplicação das evidências para a prática clínica (prática baseada em evidências), influenciar a tomada de decisão e a habilidade para avaliar as necessidades do paciente de acordo com os recursos disponíveis (HEWITT-TAYLOR, 2004).
Um conjunto de protocolos sobre determinada área de conhecimento é denominado guia de condutas ou Guideline (COREN-SP, 2014).